На 01.09.2020 весь объем образовательной деятельности, осуществляемый ГБОУ школа №123, финансируется за счет средств, выделяемых в виде субсидий из бюджета Санкт-Петербурга, расходование которых ведется с соответствие с планом финансово-хозяйственной деятельности школы.